
目的:提高分子诊断技术的分辨率,能够检测较小尺寸的外显子水平拷贝数变异(CNV)。CNV对常染色体隐性遗传(AR)疾病的贡献可以通过大量临床队列得到更好的认识。
方法:我们回顾性调查了在贝勒遗传学进行染色体微阵列分析(CMA,N=~70000)和/或临床外显子组测序(ES,N=~12000)的病例中CNV对AR状况的贡献;大多数儿童都有儿童神经发育障碍。
结果:CNVs导致87例患者的双等位基因变异,包括81个单基因和3个受影响的兄弟姐妹对。70例有影响两个等位基因的CNV,17例有CNV和单核苷酸变异(SNV)/indel。总的来说,94.3%的AR CNV影响一个基因;其中41.4%为单外显子,35.0%为多外显子部分基因事件。69%的纯合AR CNV嵌入纯合基因组区间。有5例患者在隐性疾病的完整等位基因上存在SNV/indel的大量缺失,导致多个分子诊断。
结论:由于临床CNV检测方法的局限性,AR CNV通常体积较小,世代传播,未被认识。我们在一个大型临床队列研究中的发现强调了综合CNV和SNV/indel分析用于精确的临床和分子诊断,特别是在基因组疾病的背景下。
未完待续……

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