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睡美人基因筛查确定miR-23b:BTBD7基因相互作用对结直肠癌转移至关重要

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背景:转移性结直肠癌(CRC)仍然是一种致命的疾病。识别具有高转移风险的局部晚期结直肠癌患者并改善转移性结直肠癌患者的预后需要发现转移的主要调节因子。在这种情况下,人类基因组的非编码部分仍在很大程度上未被探索。


方法:为了研究人类基因组的非编码部分并揭示大肠癌转移的调节因子,我们将基于转座子的正向遗传筛选与一种新的体外试验相结合,该试验迫使细胞在没有细胞基质和细胞间接触的情况下生长(即强制单细胞悬浮试验-fSCS)。


结果:我们证明fSCS选择具有间充质和促转移特性的结直肠癌细胞。此外,我们发现转座子插入使CRC细胞对FSC产生耐药性,从而具有转移优势。在检索到的转座子插入中,我们证明位于BTBD7的3′UTR处的转座子插入破坏miR-23b BTBD7相互作用并有助于促进转移特性。此外,miR-23b和BTBD7与CRC相关临床前实验和临床样本中的转移。


解释:fSCS是一种简单且可扩展的体外分析方法,用于研究促转移性状,基于转座子的基因筛查可以检测人类基因组的非编码部分(例如miRNA::靶相互作用)。最后,Btbd7和miR-23b都是大肠癌中有希望的预后生物标志物和治疗靶点。


未完待续……

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