在不同培养基中，胚胎培养后出生的试管婴儿未观察到甲基组差异（⬅点击左侧文字观看视频）
研究问题：人类胚胎在不同体外受精培养基中的培养是否会导致体外受精后代DNA甲基化的改变？
摘要答案：全基因组分析表明，在两项培养基研究中，试管婴儿（新生儿或9岁儿童）的培养基组之间没有显著的DNA甲基化差异。
众所周知：在体外受精（IVF）治疗过程中，胚胎在人工环境中进行着床前发育，同时进行表观遗传重编程。这一时期的逆境，如孕期热量限制，与持续的DNA甲基化异常和心脏代谢疾病的风险增加有关。体外受精子代出生时体重较低，与自然受孕的子代相比，成年后心脏代谢功能障碍的风险增加，因此早期环境逆境可能是体外受精子代中的一个问题。两个培养基试验（培养基0和培养基1）的观察结果进一步证实了这一点，即不同培养基中的胚胎培养会导致出生体重的差异。
研究设计，大小，持续时间：我们从两个体外受精培养基试验中招募单胎后代。中期研究是一项伪随机试验，比较G3（维特罗利）和K-SICM（库克）在2003-2006年进行。在9年的随访中，收集唾液（队列a）。MEDIUM1研究是一项多中心随机对照试验，比较G5（Vitrolife）和HTF（Lonza），于2010-2012年进行。脐带血（UCB）在出生时采集（B组）。
对象/材料、地点、方法：采用Infinium甲基化阵列（Illumina）对120例唾液标本（65 G3，55 Cook）和106例UCB标本（47 HTF，59 G5）进行DNA甲基化分析。混合效应线性模型，校正（孕）龄、性别、样本组成和批次效应，以及母亲年龄、妊娠并发症和B组IVF中心，在单个或聚集地点实施。甲基化异常值被定义为分别低于或高于第25百分位和第75百分位的三个四分位区间的值。
主要结果和机会的作用：120份唾液样本中111份（60份G3，51份Cook）和106份UCB样本中105份（47份HTF，58份G5）通过了我们的质量控制标准。我们筛选了性染色体上的位点，并基于质量、单核苷酸多态性的接近程度和缺失值的比例，将EPIC阵列中85万个位点中的65万-70万个留给我们分析。为了解释我们样本细胞组成的异质性，我们使用基于参考的方法估计了它们的细胞组成。首先，我们调查了单个CpG位点，在校正多次检测后，两个队列中均未发现差异甲基化位点（错误发现率校正p。阈值<0.1）。然后根据基因、启动子和CpG岛的分配将位点聚合成区域。两个队列中均未发现差异甲基化区域。对印记基因的DNA甲基化进行了靶向分析，结果显示没有差异的甲基化位点或区域。为了检验随机表观遗传改变的贡献，我们量化了每个样本中甲基化异常值的数量。尽管这表明低甲基化异常值占优势，但在a组和B组的两个培养基组中，DNA甲基化异常值的总数或分布没有差异。
局限性，谨慎的理由：这一分析目前由于缺乏与自然构想的对照组的比较而受到限制。因此，我们还不能断定在任何培养基中，体外受精胚胎培养是否与DNA甲基化异常有关。此外，考虑到大量的比较，我们可能缺乏检测微小差异的能力。
研究结果的广泛意义：尽管在不同培养基中胚胎培养后，出生体重和儿童生长存在差异，但我们没有观察到出生后保存的DNA甲基化改变。这些个体的DNA甲基化是否偏离自然受孕个体的DNA甲基化，将在不久的将来确定。
试验注册号：MEDIUM1:NTR 1979/NL1866（荷兰试验注册）
