初级免疫缺陷（PIDs）为研究人员提供了独特的模型，以了解体内免疫反应，特别是对感染的免疫力。在人类中，EB病毒（EBV）感染的免疫控制受损与几种不同免疫病理条件的发生有关；这些疾病包括非恶性和恶性B细胞淋巴增生性疾病、噬血细胞性淋巴组织细胞增多症（HLH）、严重炎症和慢性急性EBV感染T细胞。对与发展严重、慢性EBV感染易感性相关的PIDs的研究已导致识别EBV免疫的关键成分——特别是T细胞扩增及其在EBV相关疾病病理生理学中的调节的中心作用。
一方面，EBV特异性CD8 T细胞的缺陷性扩增是由参与T细胞活化的基因（如RASGRP1、MAGT1和ITK）突变引起的，DNA代谢（CTPS1）或共刺激途径（CD70、CD27和TNFSFR9（也称为CD137/4-1BB））导致增殖EBV感染的B细胞清除受损，并导致淋巴瘤的发生。另一方面，EB病毒感染的B细胞被缺陷性杀死后，T细胞的长期扩增和激活是由溶性颗粒胞吐途径成分或小衔接蛋白SH2D1A（也称为SAP）的遗传缺陷引起的，SH2D1A是T细胞和NK细胞毒性的关键激活剂。在这种情况下，EBV感染细胞的持续存在导致HLH，其特征是T细胞释放和巨噬细胞活化。此外，导致EBV感染选择性脆弱性的遗传缺陷突出了共受体分子（CD27、CD137和SLAM-R）通过特异性T-B细胞相互作用选择性参与针对感染B细胞的免疫应答的作用。
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