试管婴儿

基于网络药理学与分子对接技术探讨补肾活血方治疗反复种植失败的作用机制

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目的:联合运用网络药理学与分子对接方法分析补肾活血方治疗反复种植失败(recurrent implantation failureRIF)的作用机制。 

方法:检索数据库 TCMSP BATMAN-TCM 得到补肾活血方的药物活性成分及作用靶标;检索 GEO 数据库获得差异基因;检索 GeneCards 数据库获得 RIF 相关的已知靶基因。整合补肾活血方作用靶标与两数据库获得的基因得到交集靶蛋白。运用 Cytoscape 3.7.2软件绘制“补肾活血方 - 活性成分 - 交集靶蛋白 -RIF”网络图;利用 STRING 在线平台构建交集靶蛋白互作关系的 PPIprotein-protein interaction);使用 Metascape 数据库对交集靶蛋白进行 GO KEGG 析;最后利用 PyMoLAuTo Dock 软件对关键靶点和活性成分间的相互作用进行分子对接验证。 

结果:补肾活血方检索出 277 个靶标,GEO2R 获得显著差异基因 390 个,RIF 相关靶标 3 454 个,将药物靶标与疾病靶标相映射得到交集靶蛋白 11 个。GO 分析显示交集靶蛋白主要涉及多细胞生物稳态、内皮细胞迁移、脂质生物合成过程、水解酶活性正调控、上皮细胞迁移、平滑肌收缩、组织迁移等生物过程;小窝、膜筏、膜微域、膜区、质膜筏等细胞组成;氧化还原酶活性、血红素结合、四吡咯结合、辅因子结合、蛋白质同源二聚活性等分子功能;KEGG 信号通路主要富集在癌症途径、化学致癌、药物代谢、钙信号途径等。槲皮素、山奈酚、木犀草素等为补肾活血方的主要活性成分,前列腺素内氧化酶还原酶 2prostaglandinendoperoxide synthase 2PTGS2)、雌激素受体(1 estrogen receptor 1ESR1)、细胞色素P450 3A4酶(cytochromeP450 3A4CYP3A4)、5- 羟色胺 2A 受体(5-hydroxytryptamine receptor 2AHTR2A)等为其主要作用靶标。分子对接显示槲皮素、山奈酚、木犀草素均能与 PTGS2ESR1CYP3A4HTR2A 稳定的结合。 

结论:肾活血方中槲皮素、山奈酚、木犀草素等多种活性化合物可能通过作用于 PTGS2ESR1CYP3A4HTR2A等多种关键靶点调控癌症途径、化学致癌、药物代谢、钙信号途径等多条信号通路,发挥治疗 RIF 的作用。


未完待续……

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