试管婴儿

lncRNA相关竞争性内源性RNA网络的构建及反复植入失败中hub基因的鉴定

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背景:复发性植入失败(RIF)的机制目前尚不清楚,子宫内膜容受性差可能是主要原因之一。本研究旨在构建一个相互竞争的内源性RNA(ceRNA)网络,并确定RIF发展的潜在中枢基因。

方法:基于GSE111974数据集中的差异表达mRNA(DEM)和lncRNAs(DEL)进行加权基因共表达网络分析。使用基因本体分类和京都基因和基因组百科全书路径对基因模块进行功能富集分析。根据来自LncRNADisease、miRTarBase、miRDB和TargetScan数据库的预测性相互作用,构建了lncRNAmiRNA mRNA ceRNA调控网络。拓扑分析确定具有最高质心的关键基因,并使用公共数据集和定量实时聚合酶链反应进一步验证其表达。

结果:与对照组相比,RIF组共有1500个DEM和3个DEL显著上调,而1022个DEM和4个DEL显著下调。六个功能性共表达模块在各种生物学过程中得到了丰富,如细胞粘附、细胞运动调节和细胞对血管内皮生长因子刺激的反应。在ceRNA网络中鉴定出五个hub基因,其中GJA1在RIF子宫内膜中下调,而TET2、MAP2K6、LRRC1和TRPM6在RIF子宫内膜中上调。

结论:我们构建了一个lncRNA相关的ceRNA网络,并在RIF中鉴定了五个新的hub基因。这一发现有助于理解RIF发病的分子机制,并为其早期诊断和治疗提供新的见解。


未完待续……


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