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NRF2变异与吸烟状态相关的男性不育相关性研究中NRF2的生物信息学分析

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NRF2变异与吸烟状态相关的男性不育相关性研究中NRF2的生物信息学分析(⬅点击左侧文字观看视频)


研究问题:Nrf2多态性(-617C>A;rs6721961)和氧化应激(OS)诱导的与Nrf2相关的标志性精浆(SP)miRNA的变化为男性不育提供了可能的生物标志物?

简要回答:-617C>SNP通过精子OS DNA损伤与不孕症相关,而在吸烟者和非吸烟者的精子中差异表达的miR-582-5p和miR-20a-5p可能调节Nrf2/ARE轴。

众所周知:吸烟是导致OS的一个外在因素,它会导致精子膜损伤和DNA断裂,从而减少男性不育。与抗氧化防御系统和主要由Nrf2/ARE途径成分控制的第2阶段解毒酶相关的蛋白质的表达对于管理OS诱导的DNA损伤至关重要。在精子发生过程中,在男性生殖细胞中大量产生的miRNA在SP中被检测到,并参与与男性生殖事件相关的多种生物学过程。miRNA表达的改变可能是OS引起的,在不涉及DNA序列改变的情况下,miRNA可以提供调节Nrf2基因表达的额外机制。

研究设计、规模、持续时间:研究了100例不孕症患者和100名对照者的Nrf2基因野生型(WT)和SNP(-617)等位基因,并评估了它们与吸烟状态相关的精液参数的相关性。在不育病例中,测定精子DNA损伤水平,并比较Nrf2基因型之间的差异。使用Cytoscape软件(v3.8.2)的CluePedia(v1.5.7)插件,在miRNA mRNA调控网络上显示吸烟引起的差异表达miRNA(DEMIs)与Nrf2/ARE通路成分之间的相互作用。

参与者/材料、设置、方法:利用聚合酶链反应限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)对Nrf2 SNP(-617)进行基因分型。彗星试验分析DNA损伤。使用从GEO数据库下载的miRNA表达数据集GSE44134,通过全面的生物信息学分析鉴定DEMI。通过mirDIP门户网站确定吸烟者中DEMIs的预测目标。在从ClueMedia面板中选择STRINGactions、miRTarBase和miRecords验证的miRNA源文件后,Nrf2与其第一个邻居之间的已知相互作用被可视化。

主要结果和机会的作用:可育男性和不育男性之间的Nrf2多态性存在显著差异。A等位基因在患者组中检出率较高(P=0.001)。Nrf2的C和A等位基因频率在患者中分别为62%和38%,在对照组中分别为78%和44%。AA基因型在不育组中较高;14%对3%(P=0.001)。在吸烟者中,AA基因型的精子质量显著下降。AA基因型组的DNA损伤风险最高,为224.58 AU,而CC基因型组的DNA损伤风险最低,为164.56 AU(P<0.005)。鉴定出21个差异表达的miRNA(包括吸烟者中7个下调和14个上调)。在上调的DEMIs中,发现miR-582-5p、miR-20a-5p、miR-573、miR-186-5p、miR-499a-5p以Nrf2mRNA为靶点,表明它们是能够指示男性生殖系统抗氧化能力的生物标记物。Nrf2/Nrf2直接相互作用物与DEMIs之间的相互关系揭示了hsa-miR-20a-5p在与选择性自噬相关的SQSTM1/p62-Keap1-Nrf2轴中的调节作用。hsa-miR-582-5p被发现调节JNK/Jun/caspase-3通路,先前显示在OS反应中被激活,Jun可以激活或抑制NRF2表达。

局限性,谨慎理由:在评估吸烟影响时,少量病例削弱了我们概括结果的能力。包括其他共存因素和携带Nrf2其他功能变体的较大患者群体,以及在蛋白质水平上确认结果将进一步加强研究结果。

研究结果的更广泛含义:这项研究首次报告了土耳其人群中Nrf2基因的-617C>多态性,这种单核苷酸多态性可能通过氧化代谢导致男性生育能力受损,尤其是吸烟者。考虑到这些数据可能对确定风险组很有价值。

试用注册号:不适用