人着床前胚泡滋养层生物记录子全染色体非整倍体的研究(⬅点击左侧文字观看视频)
研究问题:人胚胎着床前胚泡滋养外胚层(TE)mRNA转录组能否预测胚胎核型?
结论:TE的mRNA转录组能准确预测染色体的非整倍体,但不能预测嵌合体或节段性非整倍体。
众所周知:人类着床前胚泡的核型已被PGT-A所公认。然而,基因组不能显示基因的表达水平,这可能推断出真倍体的发育潜力。单细胞RNA-seq分析囊胚转录组揭示了人类着床前囊胚的谱系分离。目前尚不清楚PGT-A中活组织TE的转录组能否推断出人类植入前胚泡的核型。
研究设计,大小,持续时间:共有74个TE样本来自我们生殖医学中心接受PGT治疗的患者捐献的26个囊胚。所有这些胚胎都曾被诊断为非整倍体(n=19)或整倍体(n=7),伴有单基因疾病。
对象/材料、地点、方法:采用改良的oligo-dT微珠捕获法分离所有经活检的TEs的DNA和mRNA,然后进行DNA的PGT-a和mRNA的smart2测序(G&Tseq)。在我们的PGT实验室中,用MiSeq系统(Illumina)中的PGT-A进行下一代测序,证实了活组织中的TEs的核型。利用Rstudio和R-package-InferCNV分析转录组数据,参照PGT-A结果推断的真倍体预测非整倍体。
主要结果及chance的作用:在人着床前胚泡中,通过TE的转录组可以推断出所有染色体的非整倍体,这与PGT-A的结果一致。但TE的转录组很难准确预测染色体嵌合体或片段非整倍体。
局限性,谨慎的理由:这项研究的主要局限性在于无法从mRNA转录中获得准确的拷贝数变化。在人类植入前胚泡的早期发育过程中,基因表达极不平衡。
研究结果的广泛意义:我们的数据表明mRNA转录组足以预测整个染色体的非整倍体。转录组预测嵌合体和片段非整倍体的方法和价值有待进一步研究。
试验注册号:不适用