严重的甲状腺功能不全可能导致月经失调和生育能力低下。即使在甲状腺功能恢复正常后，生育问题仍可能存在，辅助生殖技术（ART）可能是一个解决方案。在接受抗逆转录病毒治疗之前，进行卵巢刺激，导致高水平的雌二醇，这可能导致甲状腺自身免疫（TAI）妇女的甲状腺功能减退，需要在怀孕前补充左旋甲状腺素（LT4）。此外，患有多囊卵巢综合征和特发性低生育能力的妇女TAI的患病率较高。抗逆转录病毒治疗前接受LT4治疗的甲状腺功能减退妇女的血清TSH水平应<2.5mIU/L。计划进行抗逆转录病毒治疗的甲状腺功能亢进亚生育期妇女应被告知母体和胎儿并发症的风险增加，甲状腺功能正常应在抗逆转录病毒治疗前恢复并维持数月。TSH>4.0mIU/L的妇女的受精率和胚胎质量可能受损，而LT4治疗可提高受精率和胚胎质量。在主要包括TSH水平>4.0mIU/L的妇女的荟萃分析中，LT4治疗增加了活产率，但在最近2项针对甲状腺功能正常的TAI妇女的介入研究中，情况并非如此。增加使用卵胞浆内单精子注射作为一种辅助生殖技术对TAI妇女妊娠结局的重要性值得更多的研究。由于上述所有原因，生育能力不足夫妇的妇女应定期进行甲状腺疾病筛查。
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